More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4102 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  39.01 
 
 
225 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.41 
 
 
226 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
242 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  36.7 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 
228 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.98 
 
 
225 aa  131  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.41 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  34.15 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.48 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
225 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  37.76 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.07 
 
 
228 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.94 
 
 
225 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  33 
 
 
225 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  34.1 
 
 
225 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.47 
 
 
226 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.69 
 
 
223 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
225 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
226 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.43 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
237 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.61 
 
 
219 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
224 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.78 
 
 
224 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.02 
 
 
225 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  31.11 
 
 
236 aa  115  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.1 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  34.5 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
252 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
234 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
243 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  32.28 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
224 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  33.51 
 
 
210 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  32.98 
 
 
210 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27 
 
 
225 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
226 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
238 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
236 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
210 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  31.91 
 
 
210 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
226 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  31 
 
 
211 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  33.01 
 
 
235 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
228 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
248 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  30.42 
 
 
239 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 
217 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
225 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
231 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  30.35 
 
 
211 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  30.32 
 
 
214 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.92 
 
 
236 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  29.85 
 
 
211 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>