More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2644 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  68.14 
 
 
229 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  65.6 
 
 
228 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.89 
 
 
227 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
228 aa  221  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
226 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.42 
 
 
227 aa  201  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.4 
 
 
236 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
230 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
224 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
241 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
229 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.44 
 
 
227 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 
229 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.44 
 
 
227 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
227 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.46 
 
 
227 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
238 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.82 
 
 
243 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.84 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
226 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
232 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
225 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.56 
 
 
224 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
226 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
225 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.13 
 
 
226 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.56 
 
 
228 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
234 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
225 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  33.49 
 
 
222 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.92 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.15 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.15 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.27 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
237 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.63 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.94 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.1 
 
 
225 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  35.44 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.11 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.11 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
227 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.22 
 
 
225 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  34.88 
 
 
235 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 
222 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 
253 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.43 
 
 
293 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
229 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
229 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  32.5 
 
 
222 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  30.04 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.05 
 
 
225 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  30.04 
 
 
230 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  30.04 
 
 
229 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  34.73 
 
 
236 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
229 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
231 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
225 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
231 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
229 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
246 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.66 
 
 
222 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.66 
 
 
222 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
228 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30 
 
 
228 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.8 
 
 
224 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 
251 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
231 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  32 
 
 
352 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.31 
 
 
224 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
236 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
218 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 
235 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
236 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
225 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.96 
 
 
223 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  33.99 
 
 
235 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
236 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>