More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2803 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.8 
 
 
229 aa  351  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.38 
 
 
229 aa  323  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.23 
 
 
230 aa  318  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.35 
 
 
241 aa  315  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.32 
 
 
227 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.44 
 
 
227 aa  305  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.33 
 
 
229 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
228 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.67 
 
 
227 aa  168  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  167  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
238 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.78 
 
 
227 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 
236 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
228 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
231 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
226 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.41 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
234 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 
226 aa  131  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
232 aa  131  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
227 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
225 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
254 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 
243 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
225 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 
226 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.4 
 
 
222 aa  121  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
246 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
263 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
226 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.55 
 
 
224 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 
246 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 
229 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  31.28 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3331  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
258 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
239 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.63 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
218 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  36.23 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
218 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.4 
 
 
227 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
225 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.21 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.11 
 
 
226 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
229 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
229 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 
229 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.68 
 
 
236 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 
225 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 
229 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
225 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  31.8 
 
 
272 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3341  Crp/FNR family transcriptional regulator  35 
 
 
221 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
240 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.85 
 
 
223 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2689  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 
246 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 
225 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  33.66 
 
 
222 aa  104  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
231 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
231 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.88 
 
 
220 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.91 
 
 
226 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
239 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  30.73 
 
 
352 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
233 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 
227 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
231 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 
225 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
227 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
232 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 
226 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
226 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.28 
 
 
253 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.09 
 
 
228 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
226 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  31.19 
 
 
227 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.5 
 
 
238 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
236 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  28.22 
 
 
232 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
231 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.31 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
223 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>