More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0778 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  98.31 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.73 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.73 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.38 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.61 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  31.05 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.95 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.15 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  28.38 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.65 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.68 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  27.39 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  27.85 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  26.13 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.7 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.33 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.83 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  27.52 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.23 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.59 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.69 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.58 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25.5 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.76 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  26.43 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 262 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  22.39 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>