More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1691 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.94 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 252 aa  266  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  49.78 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.78 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  49.78 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.78 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  51.85 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.39 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  45 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.78 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.25 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.79 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  42.98 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.05 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  40.79 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  40.65 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  40.65 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.52 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.64 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.64 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  37.05 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.7 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  35.05 
 
 		 272 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.41 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.41 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  32.86 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2638  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.92 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3331  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3081  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0390484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.31 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.11 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.84 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  27.98 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  32.69 
 
 		 495 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  31.16 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  29.17 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  33.79 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.51 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.37 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  29.3 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  28.44 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.28 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.82 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3341  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  27.7 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>