202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3322 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 495 aa  1008    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.68 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 231 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 232 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 		 243 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  31.44 
 
 		 303 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 229 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 229 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 		 229 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 225 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 237 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  29.73 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.31 
 
 		 229 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 234 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 252 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 254 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2638  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.92 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.69 
 
 		 254 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  24.79 
 
 		 253 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  28.81 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  28.45 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  27.85 
 
 		 227 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  27.4 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.46 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 241 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 254 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 239 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.18 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  27.24 
 
 		 280 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.07 
 
 		 227 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  27.71 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  25 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.58 
 
 		 246 aa  67  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  33.54 
 
 		 268 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  25.97 
 
 		 259 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.76 
 
 		 229 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  27.6 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  25.11 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  23.19 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.48 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  25.63 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  27.31 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.27 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  26.81 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.47 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 226 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  24.45 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.25 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  24.34 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5024  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 226 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  25.23 
 
 		 223 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 236 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 		 227 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.65 
 
 		 227 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.35 
 
 		 226 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.85 
 
 		 242 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.38 
 
 		 236 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3585  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 215 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.921585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.61 
 
 		 255 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 		 236 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 240 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4212  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.07 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 		 244 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4954  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 		 223 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00163752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.72 
 
 		 227 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.63 
 
 		 223 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  33.09 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>