25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3277 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  56.03 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  38.74 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  36.32 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  37.65 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  36.18 
 
 		 303 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  36.1 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  38.72 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  33.85 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  33.85 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  28.97 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  28.07 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.27 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.61 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.12 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  25.97 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  26.83 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  25.91 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1513  hypothetical protein  26.15 
 
 		 335 aa  49.3  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000253198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  33.33 
 
 		 426 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1535  hypothetical protein  29.85 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.771018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 597 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0329077  normal  0.0287817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.86 
 
 		 531 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>