19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1968 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  554  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  99.64 
 
 
285 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  45.64 
 
 
295 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  40.38 
 
 
290 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  32.89 
 
 
253 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  34.94 
 
 
263 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.19 
 
 
433 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  33.85 
 
 
259 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.02 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.74 
 
 
430 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  28.63 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  29.46 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  27.31 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  25.56 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  28.69 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  27.24 
 
 
495 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  34.03 
 
 
426 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.71 
 
 
492 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
531 aa  49.3  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>