177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3525 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 433 aa  827    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.35 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.59 
 
 		 430 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  40.48 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  37.87 
 
 		 295 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  32.19 
 
 		 280 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  31.76 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  36.4 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  28.27 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  30.26 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  31.87 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.83 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  32.16 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  31.38 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.15 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  45.65 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.94 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  44.68 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  40 
 
 		 191 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.24 
 
 		 194 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.1 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.83 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.49 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.33 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.2 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  48.72 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.43 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.78 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.38 
 
 		 196 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.21 
 
 		 195 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  34.23 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.28 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  31.35 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.72 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.81 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.81 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 208 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.52 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  32.63 
 
 		 201 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  25.64 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.55 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.36 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  31.08 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.56 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.2 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  27.27 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.29 
 
 		 196 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  36.96 
 
 		 188 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.56 
 
 		 202 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.46 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1437  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.3 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.09 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.46 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1538  ANTAR domain protein with unknown sensor  44.16 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.585588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.31 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2508  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.56 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102211  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.36 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.3 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.3 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2735  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.86 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0721448  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.3 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1141  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.74 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.36 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.07 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.07 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0664  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.86 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.293281  normal  0.015345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01489  histidine kinase/response regulator hybrid protein  40 
 
 		 83 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.52 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.3 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.65 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.71 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  37.36 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.3 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  46.15 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  37.36 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  38.46 
 
 		 192 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  31.15 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  37.63 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  37.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.19 
 
 		 191 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  37.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  37.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  37.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  37.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  37.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.3 
 
 		 227 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.36 
 
 		 192 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05586  hypothetical protein  34.33 
 
 		 193 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.56 
 
 		 195 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  36.26 
 
 		 191 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  38.3 
 
 		 226 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  36.26 
 
 		 191 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.97 
 
 		 193 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.3 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001606  putative two-component response regulatory protein  32.84 
 
 		 193 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.16 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  42.25 
 
 		 207 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>