23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1406 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  540  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  56.03 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  38.89 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  32.63 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  35.35 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  37.12 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  33.89 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  31.35 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  34.94 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  34.94 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  29.24 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  28.81 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.26 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  25.81 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.65 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.97 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  23.31 
 
 		 459 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  31.14 
 
 		 426 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 		 531 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1513  hypothetical protein  28.71 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000253198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1579  hypothetical protein  23.38 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.287753  normal  0.662374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>