35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0711 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  938    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1513  hypothetical protein  27.13 
 
 		 335 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000253198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.9 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  30.26 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1535  hypothetical protein  34.17 
 
 		 225 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.771018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  25.91 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  22.72 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  22.43 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  29.72 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  22.43 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 		 941 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 		 531 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  22.75 
 
 		 686 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 		 680 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.05 
 
 		 686 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  29.68 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  23.31 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  21.88 
 
 		 643 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  28.47 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  27.15 
 
 		 531 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  31.13 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 674 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  23.66 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  34.41 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.21 
 
 		 527 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.96 
 
 		 637 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  25.12 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  32.89 
 
 		 882 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.63 
 
 		 686 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.63 
 
 		 686 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  35.87 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  32.97 
 
 		 290 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>