More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1826 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
650 aa  1311    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  59.72 
 
 
708 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  57.67 
 
 
713 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.19 
 
 
563 aa  350  5e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  54.79 
 
 
563 aa  348  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  52.56 
 
 
563 aa  347  6e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 
656 aa  343  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  52.79 
 
 
656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  49.44 
 
 
633 aa  326  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  50.73 
 
 
566 aa  322  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 
650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 
652 aa  292  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
682 aa  288  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 
663 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
627 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
625 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 
546 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
621 aa  258  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
530 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  30.14 
 
 
634 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
536 aa  238  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.87 
 
 
638 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  42.81 
 
 
626 aa  228  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
533 aa  225  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 
636 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 
634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
637 aa  213  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
633 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
633 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
633 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 
687 aa  187  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.52 
 
 
637 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 
545 aa  170  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.82 
 
 
695 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 
626 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  33.63 
 
 
533 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 
549 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.57 
 
 
549 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.09 
 
 
619 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 
549 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  28.34 
 
 
638 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.99 
 
 
650 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 
941 aa  158  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 
640 aa  157  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 
545 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 
543 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 
661 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  29.83 
 
 
569 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 
495 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
660 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0544  MCP-domain signal transduction protein  32.25 
 
 
530 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  31.95 
 
 
660 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 
700 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.98 
 
 
533 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  30.05 
 
 
658 aa  151  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 
645 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.42 
 
 
564 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  38.34 
 
 
697 aa  150  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 
667 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  32.21 
 
 
660 aa  150  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.17 
 
 
530 aa  150  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
380 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.79 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.56 
 
 
632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 
532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.75 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  31.93 
 
 
545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  31.73 
 
 
545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  30.5 
 
 
578 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  37.98 
 
 
584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  37.98 
 
 
593 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  31.69 
 
 
660 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  39.62 
 
 
545 aa  147  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
554 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.38 
 
 
777 aa  146  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
554 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 
525 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.42 
 
 
554 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
554 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.42 
 
 
650 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 
634 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318926  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
554 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 
495 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
554 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 
671 aa  145  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 
674 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 
545 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  32.39 
 
 
543 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  31.85 
 
 
650 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  36.68 
 
 
564 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 
688 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 
538 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  32.79 
 
 
771 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>