More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1331 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
563 aa  1120    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  65.37 
 
 
566 aa  701    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  68.27 
 
 
656 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  50.88 
 
 
563 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
563 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  58.92 
 
 
656 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
708 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
713 aa  356  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  53.24 
 
 
650 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
633 aa  309  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 
682 aa  291  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
652 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 
546 aa  281  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 
625 aa  258  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  41.78 
 
 
627 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
621 aa  249  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  39.02 
 
 
626 aa  242  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
530 aa  239  8e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
536 aa  239  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
533 aa  232  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 
558 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
650 aa  200  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 
554 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  29.04 
 
 
554 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.74 
 
 
554 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 
554 aa  193  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.74 
 
 
554 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.74 
 
 
554 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.74 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 
564 aa  190  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 
568 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 
554 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.87 
 
 
554 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.66 
 
 
554 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 
554 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.69 
 
 
554 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 
554 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.76 
 
 
554 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 
636 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
554 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
637 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 
555 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.32 
 
 
554 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 
634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 
541 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
530 aa  171  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.07 
 
 
533 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.84 
 
 
540 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.07 
 
 
533 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
668 aa  169  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  26.91 
 
 
564 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33.89 
 
 
634 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.38 
 
 
548 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 
549 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
554 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 
569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  28.48 
 
 
549 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 
634 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 
541 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  32.28 
 
 
553 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.49 
 
 
568 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  31.22 
 
 
557 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.85 
 
 
574 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 
549 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.55 
 
 
647 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 
647 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 
559 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.95 
 
 
544 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
638 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  30.65 
 
 
545 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 
640 aa  158  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.87 
 
 
650 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  31.31 
 
 
545 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  28.07 
 
 
561 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
702 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 
638 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  31.98 
 
 
553 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  32.33 
 
 
642 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 
648 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
380 aa  154  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 
674 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  27.77 
 
 
556 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.75 
 
 
544 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.48 
 
 
647 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  30.21 
 
 
643 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 
548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.2 
 
 
646 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 
543 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.52 
 
 
545 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
570 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  33.06 
 
 
638 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 
541 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  24.3 
 
 
538 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 
667 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 
674 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>