More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0269 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
663 aa  1321    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 
650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  41.21 
 
 
694 aa  260  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.54 
 
 
941 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  40.7 
 
 
700 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  40.43 
 
 
700 aa  253  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 
700 aa  250  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  39.79 
 
 
540 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  38.79 
 
 
659 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  38.04 
 
 
659 aa  247  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  37.91 
 
 
663 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  39.73 
 
 
731 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  40.22 
 
 
678 aa  244  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  40.46 
 
 
665 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  40.46 
 
 
662 aa  242  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  40.46 
 
 
651 aa  242  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  39.58 
 
 
653 aa  241  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  40.75 
 
 
664 aa  241  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  40.83 
 
 
657 aa  236  8e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  37.88 
 
 
658 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  37.99 
 
 
653 aa  234  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  40.56 
 
 
656 aa  234  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  38.52 
 
 
651 aa  233  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  36.47 
 
 
656 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
649 aa  230  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  40.75 
 
 
660 aa  229  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  35.6 
 
 
596 aa  228  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  36.11 
 
 
652 aa  226  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  36.76 
 
 
654 aa  224  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  34.47 
 
 
655 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  34.47 
 
 
655 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 
544 aa  223  6e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  37.23 
 
 
657 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  36.87 
 
 
654 aa  218  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 
545 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 
604 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  39.36 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  26.28 
 
 
1170 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.84 
 
 
638 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  41.53 
 
 
236 aa  162  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 
687 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 
634 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 
634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.7 
 
 
637 aa  134  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  27.24 
 
 
650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.71 
 
 
695 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 
653 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  50.41 
 
 
530 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.88 
 
 
675 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.870162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 
621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  34.5 
 
 
418 aa  118  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
656 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  32.22 
 
 
421 aa  118  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 
635 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  35.27 
 
 
459 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0274  hypothetical protein  30.47 
 
 
282 aa  117  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 
459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.13 
 
 
651 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.8 
 
 
727 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0173671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  29.85 
 
 
625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 
459 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.37 
 
 
682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
627 aa  114  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
372 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  66.27 
 
 
380 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  34.95 
 
 
566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 
658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  33 
 
 
656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
675 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0971  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.38 
 
 
777 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271758  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.8 
 
 
388 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  39.41 
 
 
666 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.53 
 
 
1032 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 
664 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3671  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 
509 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.353813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3844  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 
556 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.32 
 
 
601 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1479  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.34 
 
 
640 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0522747  normal  0.0374393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 
628 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 
557 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 
553 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  33.11 
 
 
483 aa  110  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.4 
 
 
563 aa  110  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  34.68 
 
 
661 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 
509 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02969  Methyl-accepting chemotaxis protein  37.45 
 
 
529 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0476708  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.79 
 
 
632 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  52.53 
 
 
563 aa  110  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  56.31 
 
 
633 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 
830 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.1 
 
 
720 aa  109  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  52.53 
 
 
563 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  48.63 
 
 
720 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.61 
 
 
676 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.776318  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.54 
 
 
608 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.816188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  57.89 
 
 
546 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
421 aa  108  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>