More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1698 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  58.46 
 
 
596 aa  652    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
653 aa  1301    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  55.62 
 
 
652 aa  673    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  56.47 
 
 
657 aa  683    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  73.7 
 
 
544 aa  482  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  40.92 
 
 
660 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  71.68 
 
 
545 aa  462  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  41.28 
 
 
665 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  41.46 
 
 
664 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  41.7 
 
 
653 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 
649 aa  444  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  41.22 
 
 
662 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  40.93 
 
 
658 aa  437  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  39.15 
 
 
654 aa  435  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  46.31 
 
 
656 aa  423  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  46.11 
 
 
659 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  45.57 
 
 
657 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  45.56 
 
 
659 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  39.63 
 
 
678 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  36.84 
 
 
663 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  40.71 
 
 
655 aa  404  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  40.71 
 
 
655 aa  404  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  45.78 
 
 
540 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  43.45 
 
 
651 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 
700 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  39.55 
 
 
604 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 
700 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  42 
 
 
700 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  43.47 
 
 
731 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  38.22 
 
 
694 aa  350  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  36.92 
 
 
654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  47.59 
 
 
656 aa  317  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.79 
 
 
651 aa  310  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  46.2 
 
 
553 aa  262  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  58.05 
 
 
236 aa  251  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.99 
 
 
663 aa  234  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  29.73 
 
 
625 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 
621 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  28.78 
 
 
627 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 
629 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  25.13 
 
 
623 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  26.46 
 
 
630 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.28 
 
 
626 aa  151  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.48 
 
 
660 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  23.73 
 
 
623 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.39 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  25.81 
 
 
639 aa  147  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 
630 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.11 
 
 
630 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.11 
 
 
630 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.34 
 
 
660 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.11 
 
 
630 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  25.21 
 
 
650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  25.62 
 
 
650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  25.21 
 
 
650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  25.21 
 
 
660 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.39 
 
 
660 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  25.21 
 
 
660 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  27.33 
 
 
660 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  26.77 
 
 
660 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.68 
 
 
661 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  27.04 
 
 
660 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  25.49 
 
 
660 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  26.45 
 
 
629 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  26.99 
 
 
660 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  26.01 
 
 
652 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  27.04 
 
 
660 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  26.11 
 
 
658 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  25.08 
 
 
629 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.19 
 
 
650 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  24.88 
 
 
660 aa  138  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 
630 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.42 
 
 
626 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  27.53 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 
622 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  26.55 
 
 
626 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  26.6 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  27.53 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  27.33 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  27.53 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 
625 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  26.6 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  27.53 
 
 
660 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  25.09 
 
 
629 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.23 
 
 
624 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  24.62 
 
 
728 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.94 
 
 
622 aa  133  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.1 
 
 
660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.1 
 
 
660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.03 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.34 
 
 
622 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.26 
 
 
627 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  25.21 
 
 
696 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  24.01 
 
 
721 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.34 
 
 
660 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 
372 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.25 
 
 
832 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.04 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.1 
 
 
659 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.57 
 
 
696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>