More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1648 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
832 aa  1697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.79 
 
 
695 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  26.63 
 
 
676 aa  193  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2692  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 
768 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
1475 aa  183  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 
1474 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.75 
 
 
681 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  26.09 
 
 
660 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  26.09 
 
 
660 aa  170  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  25.86 
 
 
660 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  25.86 
 
 
660 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2364  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  26.38 
 
 
702 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  25.03 
 
 
660 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 
632 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.44 
 
 
695 aa  163  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 
957 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  29.93 
 
 
695 aa  162  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 
677 aa  161  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.86 
 
 
673 aa  161  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000001862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.44 
 
 
650 aa  160  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.9 
 
 
832 aa  158  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2125  methyl-accepting chemotaxis protein  47.32 
 
 
514 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  25.97 
 
 
660 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0485  aerotaxis sensor receptor  46.34 
 
 
514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1814  aerotaxis receptor  46.34 
 
 
514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0801  methyl-accepting chemotaxis protein  46.34 
 
 
514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0387  aerotaxis sensor receptor  46.34 
 
 
514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0904499  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2118  methyl-accepting chemotaxis protein  46.34 
 
 
514 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1487  methyl-accepting chemotaxis protein  46.34 
 
 
494 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  30.84 
 
 
740 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 
679 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
519 aa  154  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.13 
 
 
553 aa  153  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.19 
 
 
518 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  41.7 
 
 
553 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.7 
 
 
553 aa  151  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  41.7 
 
 
553 aa  151  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  41.7 
 
 
553 aa  151  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.7 
 
 
553 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  41.7 
 
 
553 aa  151  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1224  aerotaxis sensor receptor transmembrane protein  46.11 
 
 
514 aa  151  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229455  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
699 aa  151  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.74 
 
 
1170 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  41.02 
 
 
557 aa  150  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  41.28 
 
 
472 aa  150  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  41.7 
 
 
553 aa  150  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.06 
 
 
586 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  41.02 
 
 
557 aa  150  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 
557 aa  150  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.95 
 
 
713 aa  150  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000208845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 
549 aa  150  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 
628 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  24.77 
 
 
663 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
557 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  25.57 
 
 
660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.08 
 
 
555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
564 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000740162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
541 aa  149  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  42.72 
 
 
533 aa  148  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.69 
 
 
592 aa  148  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.377399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
628 aa  147  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  42.72 
 
 
533 aa  147  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
630 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 
583 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.5 
 
 
657 aa  147  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.63052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  42.72 
 
 
533 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0766  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  28.46 
 
 
745 aa  147  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.33 
 
 
657 aa  147  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  44.86 
 
 
669 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.79 
 
 
553 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  42.72 
 
 
533 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.79 
 
 
553 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 
698 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  44.86 
 
 
623 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.79 
 
 
553 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0618  methyl-accepting chemotaxis protein  43.93 
 
 
583 aa  147  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
650 aa  147  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.894021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
561 aa  147  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
569 aa  147  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  42.72 
 
 
533 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.79 
 
 
553 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
527 aa  146  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.79 
 
 
553 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  44.86 
 
 
580 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 
688 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2473  methyl-accepting chemotaxis protein  44.86 
 
 
580 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
561 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
680 aa  146  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
566 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2685  methyl-accepting chemotaxis protein  44.86 
 
 
580 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0760  aerotaxis sensor receptor  44.86 
 
 
583 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2390  methyl-accepting chemotaxis protein  44.86 
 
 
580 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.790589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
533 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  42.25 
 
 
533 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
556 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  42.25 
 
 
533 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27960  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
575 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187216  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.11 
 
 
880 aa  145  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
659 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>