More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2982 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  73.55 
 
 
536 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  73.55 
 
 
536 aa  739    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
541 aa  1085    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  56.02 
 
 
533 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  56.85 
 
 
533 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.17 
 
 
533 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  56.02 
 
 
533 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  57.17 
 
 
533 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  56.78 
 
 
533 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  55.83 
 
 
533 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  56.78 
 
 
533 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  56.98 
 
 
533 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  57.09 
 
 
533 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.39 
 
 
562 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  55.81 
 
 
557 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.81 
 
 
557 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  55.81 
 
 
557 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.04 
 
 
556 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.1 
 
 
566 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.97 
 
 
561 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.62 
 
 
561 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  55.45 
 
 
551 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.45 
 
 
551 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  55.45 
 
 
551 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.45 
 
 
554 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.45 
 
 
554 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.45 
 
 
554 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.43 
 
 
586 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.45 
 
 
554 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.45 
 
 
557 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.26 
 
 
551 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.53 
 
 
552 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.17 
 
 
553 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.17 
 
 
553 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  55.17 
 
 
553 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.51 
 
 
553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.12 
 
 
562 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.8 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.12 
 
 
553 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.12 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.12 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.01 
 
 
547 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.92 
 
 
553 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.92 
 
 
553 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.82 
 
 
547 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.82 
 
 
547 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  53.01 
 
 
547 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.28 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.62 
 
 
547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.36 
 
 
553 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.09 
 
 
553 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.09 
 
 
553 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  50.09 
 
 
553 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.09 
 
 
553 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.09 
 
 
553 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  49.91 
 
 
553 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.29 
 
 
549 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 
556 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 
540 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 
540 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.77 
 
 
556 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 
575 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
536 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 
567 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.96 
 
 
555 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
546 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.05 
 
 
555 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
579 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  47.47 
 
 
579 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
661 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 
567 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2180  methyl-accepting chemotaxis protein  47.1 
 
 
537 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0470297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.74 
 
 
570 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.03 
 
 
560 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 
556 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
570 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.31 
 
 
557 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.73 
 
 
560 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
574 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.56 
 
 
564 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  53.47 
 
 
546 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.47 
 
 
546 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  53.47 
 
 
546 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0300  methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
537 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.97 
 
 
546 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  54.92 
 
 
470 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  53.47 
 
 
546 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.9 
 
 
651 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
572 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.97 
 
 
546 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  53.47 
 
 
546 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.12 
 
 
560 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.38 
 
 
545 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
573 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1744  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.95 
 
 
535 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.693576  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.14 
 
 
547 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.81 
 
 
573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.14 
 
 
547 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1740  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.95 
 
 
541 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.14 
 
 
547 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.601659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>