More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2952 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95 
 
 
540 aa  1004    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.96 
 
 
536 aa  830    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
540 aa  1080    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.9 
 
 
539 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.8 
 
 
539 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2180  methyl-accepting chemotaxis protein  64.79 
 
 
537 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0470297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.93 
 
 
539 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.93 
 
 
539 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.323965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.8 
 
 
541 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.93 
 
 
539 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.57 
 
 
544 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258744 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0300  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 
537 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0392  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 
531 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.147858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1860  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 
537 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0534573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1156  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 
537 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.709617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0869  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 
537 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365744  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2133  methyl-accepting chemotaxis protein  64.59 
 
 
537 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1744  methyl-accepting chemotaxis protein  64.4 
 
 
537 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
566 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 
541 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.87 
 
 
562 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  47.44 
 
 
551 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
561 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 
554 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.62 
 
 
554 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  47.44 
 
 
551 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.41 
 
 
554 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.62 
 
 
557 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.62 
 
 
554 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
551 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  47.21 
 
 
557 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.31 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 
557 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  47.21 
 
 
557 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.25 
 
 
551 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.8 
 
 
553 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
556 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
555 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  47.13 
 
 
536 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.62 
 
 
553 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  47.13 
 
 
536 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.79 
 
 
553 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.52 
 
 
553 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.43 
 
 
553 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.43 
 
 
553 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.79 
 
 
553 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.79 
 
 
553 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.97 
 
 
553 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.98 
 
 
553 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.64 
 
 
553 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
553 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.64 
 
 
553 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.64 
 
 
553 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  45.64 
 
 
553 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  42.99 
 
 
533 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.64 
 
 
553 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 
552 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
553 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.75 
 
 
547 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  42.56 
 
 
547 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.56 
 
 
547 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.37 
 
 
547 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.37 
 
 
547 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  42.78 
 
 
533 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  42.88 
 
 
533 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  42.67 
 
 
533 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  42.67 
 
 
533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
618 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
533 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  42.48 
 
 
533 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  42.48 
 
 
533 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  42.48 
 
 
533 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  42.48 
 
 
533 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
617 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 
567 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 
562 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 
655 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 
648 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
648 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
659 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 
588 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 
597 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.7 
 
 
671 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 
556 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.51 
 
 
673 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 
673 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 
673 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.51 
 
 
673 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 
673 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  45.31 
 
 
673 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
578 aa  337  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
546 aa  336  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.56 
 
 
583 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 
657 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
519 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
556 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.29 
 
 
666 aa  334  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>