More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3813 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.72 
 
 		 657 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  72.97 
 
 		 673 aa  680    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  72.97 
 
 		 673 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  72.97 
 
 		 673 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.1 
 
 		 659 aa  725    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  73.36 
 
 		 673 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  72.97 
 
 		 673 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 617 aa  1221    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  73.17 
 
 		 673 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.99 
 
 		 655 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  73.17 
 
 		 671 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.74 
 
 		 648 aa  732    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.32 
 
 		 618 aa  1026    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.9 
 
 		 597 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.53 
 
 		 659 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.06 
 
 		 648 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.53 
 
 		 659 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 		 522 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 		 522 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 		 615 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 		 615 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.44 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  49.33 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 		 547 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.46 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.99 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.12 
 
 		 539 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  52.11 
 
 		 616 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 		 595 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.76 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 		 608 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.39 
 
 		 566 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 		 608 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.79 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0431  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.72 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 		 605 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  43.83 
 
 		 608 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  50.47 
 
 		 634 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  50.47 
 
 		 626 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  50.28 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.56 
 
 		 596 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.7 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  66.56 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  48.25 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 		 524 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.78 
 
 		 601 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947036  normal  0.198959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 		 579 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 		 540 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.98 
 
 		 569 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.46 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.65 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.78 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.02 
 
 		 587 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 		 536 aa  359  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 		 519 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 		 519 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 		 519 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 		 588 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3683  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 		 613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.755698  normal  0.0578518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 		 557 aa  357  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.56 
 
 		 594 aa  356  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00034667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0335  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.22 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.809135  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 		 519 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.08 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 		 588 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 		 588 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.41 
 
 		 557 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.78 
 
 		 513 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.6 
 
 		 585 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  64.41 
 
 		 557 aa  355  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  64.41 
 
 		 557 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.83 
 
 		 578 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.69 
 
 		 598 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  61.7 
 
 		 585 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.47 
 
 		 519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.99 
 
 		 527 aa  353  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  66.45 
 
 		 551 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  45.9 
 
 		 536 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  45.9 
 
 		 536 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>