More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1588 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66 
 
 		 588 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.82 
 
 		 612 aa  849    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  69.78 
 
 		 621 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  72.57 
 
 		 616 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 588 aa  1155    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  70.15 
 
 		 626 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.99 
 
 		 601 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.5 
 
 		 595 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.58 
 
 		 588 aa  945    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.54 
 
 		 587 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.58 
 
 		 588 aa  945    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.39 
 
 		 587 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.72 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.33 
 
 		 608 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.33 
 
 		 608 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.87 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  53.12 
 
 		 513 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.49 
 
 		 524 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  54.39 
 
 		 600 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  49.67 
 
 		 608 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  52.61 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.33 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0480332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 		 615 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 		 615 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.35 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 		 605 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 		 648 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.69 
 
 		 617 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  51.26 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  51.46 
 
 		 518 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.49 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  51.26 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  51.26 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 519 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.74 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 		 618 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 		 648 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.29 
 
 		 580 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.37 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.37 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 		 657 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 		 519 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 		 589 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 		 659 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.6 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 		 579 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.35 
 
 		 673 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 		 673 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.66 
 
 		 569 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 		 585 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.81 
 
 		 553 aa  365  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 		 673 aa  364  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.99 
 
 		 555 aa  364  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.35 
 
 		 673 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 		 673 aa  364  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 		 673 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.35 
 
 		 671 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 575 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 		 589 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 		 549 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  56.79 
 
 		 547 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  59.15 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.69 
 
 		 578 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 		 587 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 567 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.48 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.48 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.48 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  59.48 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.48 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.48 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  56.79 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.72 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  56.79 
 
 		 547 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.96 
 
 		 555 aa  361  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.2 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51670  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 		 566 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  56.79 
 
 		 547 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.12 
 
 		 516 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.4 
 
 		 559 aa  360  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  56.51 
 
 		 547 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.39 
 
 		 598 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.25 
 
 		 553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>