More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1460 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  100 
 
 		 513 aa  1009    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.93 
 
 		 513 aa  811    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  54.47 
 
 		 616 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 		 601 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 		 588 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.65 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.65 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  53.7 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 		 608 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 		 608 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.89 
 
 		 634 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  53.89 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.46 
 
 		 570 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  53.7 
 
 		 621 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.62 
 
 		 588 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  51.94 
 
 		 600 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  50.68 
 
 		 608 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.63 
 
 		 514 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.4 
 
 		 587 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.66 
 
 		 595 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.91 
 
 		 612 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 		 519 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.78 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.2 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  49.32 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  49.32 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 		 538 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.85 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 		 617 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.45 
 
 		 605 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  49.32 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 		 542 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 		 618 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  48.01 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  48.01 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  48.01 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  49.22 
 
 		 671 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.22 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  49.03 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.84 
 
 		 542 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.864566 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  49.03 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.84 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.84 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.84 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.84 
 
 		 673 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 648 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 		 655 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.84 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 		 659 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 		 549 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.22 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.22 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 		 549 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  49.25 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 		 648 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.51 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.44 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 		 597 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 		 659 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.37 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 		 659 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 		 657 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 		 516 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  60 
 
 		 524 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.03 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0480332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.39 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.2 
 
 		 585 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.49 
 
 		 569 aa  358  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 		 554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 562 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 		 589 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 		 579 aa  356  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 		 553 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.32 
 
 		 562 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.52 
 
 		 559 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.6 
 
 		 513 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.46 
 
 		 552 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.31 
 
 		 661 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.64 
 
 		 527 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.34 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.09 
 
 		 584 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.72 
 
 		 614 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  65.94 
 
 		 584 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>