More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2259 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.29 
 
 
588 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  68.88 
 
 
634 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  68.88 
 
 
626 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.23 
 
 
612 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
588 aa  1174    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  68.87 
 
 
616 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.93 
 
 
595 aa  793    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.69 
 
 
601 aa  935    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.84 
 
 
587 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  68.69 
 
 
621 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.8 
 
 
588 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.48 
 
 
587 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.8 
 
 
588 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.85 
 
 
608 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.85 
 
 
608 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.12 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.66 
 
 
538 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.88 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  54.91 
 
 
600 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  51.97 
 
 
513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  53.38 
 
 
515 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 
570 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  47.79 
 
 
608 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.06 
 
 
510 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0480332  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
542 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
596 aa  415  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.17 
 
 
605 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
615 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
615 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.76 
 
 
519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.66 
 
 
519 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
618 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
519 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
617 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
572 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  52.24 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  52.24 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  52.24 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  51.72 
 
 
518 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  51.36 
 
 
530 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  51.36 
 
 
530 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  51.36 
 
 
530 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.81 
 
 
514 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  44.35 
 
 
673 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.42 
 
 
673 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.44 
 
 
566 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.89 
 
 
555 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 
659 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.23 
 
 
673 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.23 
 
 
673 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.23 
 
 
673 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
655 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.23 
 
 
673 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.42 
 
 
671 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.08 
 
 
648 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 
535 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
519 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
659 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
648 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
659 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.93 
 
 
666 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.21 
 
 
542 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
597 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.78 
 
 
657 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.83 
 
 
552 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  59.32 
 
 
547 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.04 
 
 
547 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.53 
 
 
578 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.04 
 
 
547 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
585 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
579 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
575 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.04 
 
 
547 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 
549 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
549 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.9 
 
 
580 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
562 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
559 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.68 
 
 
522 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.04 
 
 
547 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.58 
 
 
598 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.11 
 
 
569 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
587 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.68 
 
 
522 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 
561 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.42 
 
 
513 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.15 
 
 
589 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
589 aa  365  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.71 
 
 
580 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.51 
 
 
556 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
521 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 
583 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.36 
 
 
559 aa  362  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 
584 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
532 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1955  methyl-accepting chemotaxis protein  46.68 
 
 
685 aa  360  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 
541 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>