More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0277 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
530 aa  1069    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.84 
 
 
519 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.31 
 
 
519 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.26 
 
 
519 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  99.79 
 
 
518 aa  956    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
530 aa  1069    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  99.79 
 
 
518 aa  956    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.26 
 
 
519 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  97.48 
 
 
518 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  99.79 
 
 
518 aa  956    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.1 
 
 
519 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.05 
 
 
519 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.1 
 
 
519 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
530 aa  1069    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.07 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.6 
 
 
608 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.6 
 
 
608 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  54.37 
 
 
600 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.69 
 
 
542 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.864566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.58 
 
 
513 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.24 
 
 
601 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.69 
 
 
605 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.36 
 
 
588 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.22 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
570 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  51.25 
 
 
616 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  48.73 
 
 
515 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 
615 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 
615 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.21 
 
 
588 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.31 
 
 
595 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  46.33 
 
 
608 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  50.93 
 
 
634 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.46 
 
 
588 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.46 
 
 
588 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 
612 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  51.15 
 
 
626 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  50.94 
 
 
621 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 
587 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
655 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
617 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
648 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 
521 aa  359  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 
522 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 
522 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
648 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
618 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.62 
 
 
587 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 
597 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.79 
 
 
659 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.25 
 
 
657 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 
659 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 
659 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.55 
 
 
673 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.63 
 
 
549 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  45.55 
 
 
673 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.55 
 
 
673 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.55 
 
 
673 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  46.78 
 
 
524 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.55 
 
 
671 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.55 
 
 
673 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.47 
 
 
549 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.55 
 
 
673 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.55 
 
 
666 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
524 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 
538 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  44.27 
 
 
547 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  44.27 
 
 
547 aa  329  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  44.27 
 
 
547 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  44.06 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  55.07 
 
 
513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  44.06 
 
 
547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
542 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
556 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 
572 aa  324  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
510 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0480332  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.82 
 
 
553 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.82 
 
 
553 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.82 
 
 
553 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.82 
 
 
553 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
515 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.44 
 
 
547 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.69 
 
 
587 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
554 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.45 
 
 
554 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
551 aa  320  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 
561 aa  320  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.45 
 
 
557 aa  320  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  42.45 
 
 
551 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.94 
 
 
513 aa  320  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
589 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  42.45 
 
 
551 aa  320  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.45 
 
 
554 aa  319  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
596 aa  320  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.45 
 
 
554 aa  320  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.74 
 
 
520 aa  319  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.03 
 
 
520 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
536 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
536 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 
532 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>