More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1527 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.39 
 
 
588 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.66 
 
 
588 aa  710    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  70.97 
 
 
634 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.63 
 
 
612 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  71.98 
 
 
616 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
587 aa  1150    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.64 
 
 
601 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  71.16 
 
 
626 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.93 
 
 
588 aa  823    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  70.78 
 
 
621 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  97.79 
 
 
587 aa  907    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.45 
 
 
595 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.93 
 
 
588 aa  823    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.5 
 
 
538 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.13 
 
 
524 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.69 
 
 
570 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
513 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.84 
 
 
608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.84 
 
 
608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  52.59 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  54.39 
 
 
600 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  48.84 
 
 
608 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  52.61 
 
 
515 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.73 
 
 
510 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0480332  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.53 
 
 
572 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.34 
 
 
605 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 
542 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
596 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
617 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.05 
 
 
514 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  51.94 
 
 
518 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  52.15 
 
 
518 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  51.94 
 
 
518 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  51.94 
 
 
518 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
566 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 
519 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
618 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 
519 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 
519 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 
519 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
530 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
521 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 
519 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
530 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  50.41 
 
 
530 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.39 
 
 
580 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 
519 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
562 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.43 
 
 
552 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
579 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 
589 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 
519 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.72 
 
 
567 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  60.69 
 
 
553 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
559 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  60.69 
 
 
553 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  60.69 
 
 
553 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  60.69 
 
 
553 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  60.69 
 
 
553 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  59.54 
 
 
547 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.25 
 
 
561 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.23 
 
 
555 aa  364  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 
648 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.54 
 
 
547 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.54 
 
 
547 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 
583 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
562 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.54 
 
 
547 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.36 
 
 
569 aa  362  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 
522 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  47.2 
 
 
513 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 
522 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
556 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  56.99 
 
 
553 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.73 
 
 
648 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
541 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.35 
 
 
673 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 
673 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.4 
 
 
673 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.35 
 
 
673 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.35 
 
 
673 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.4 
 
 
673 aa  359  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 
655 aa  359  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.39 
 
 
549 aa  359  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.96 
 
 
547 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
532 aa  359  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  44.76 
 
 
671 aa  359  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  53.14 
 
 
557 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 
585 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.93 
 
 
553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.36 
 
 
578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.05 
 
 
575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.93 
 
 
553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 
557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.77 
 
 
553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  54.42 
 
 
557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.13 
 
 
666 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.63 
 
 
598 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>