More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2079 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.88 
 
 
553 aa  818    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.88 
 
 
553 aa  818    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.52 
 
 
553 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  99.64 
 
 
553 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  78.88 
 
 
553 aa  818    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  99.64 
 
 
553 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.52 
 
 
553 aa  815    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  99.46 
 
 
553 aa  1109    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.88 
 
 
553 aa  818    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.88 
 
 
553 aa  818    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.68 
 
 
555 aa  818    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  99.82 
 
 
553 aa  1115    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  100 
 
 
553 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.34 
 
 
553 aa  811    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.36 
 
 
586 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.78 
 
 
556 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.54 
 
 
566 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  59.17 
 
 
551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.71 
 
 
562 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.35 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  59.17 
 
 
551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.81 
 
 
551 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.17 
 
 
554 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.17 
 
 
554 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.07 
 
 
557 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.99 
 
 
551 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.82 
 
 
553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.82 
 
 
553 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.99 
 
 
554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.64 
 
 
553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  58.11 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.64 
 
 
553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  58.29 
 
 
557 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.29 
 
 
557 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.54 
 
 
561 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.9 
 
 
561 aa  558  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 
552 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  53.94 
 
 
547 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.3 
 
 
472 aa  527  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.76 
 
 
547 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.58 
 
 
547 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.58 
 
 
547 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.41 
 
 
547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 
562 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.26 
 
 
556 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.07 
 
 
549 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.97 
 
 
556 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.92 
 
 
541 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  51.24 
 
 
536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  51.24 
 
 
536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.32 
 
 
556 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
575 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
567 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  47.89 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  47.89 
 
 
533 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  47.67 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.51 
 
 
533 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  47.89 
 
 
533 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  47.51 
 
 
533 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  47.13 
 
 
533 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  47.51 
 
 
533 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  47.13 
 
 
533 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  47.32 
 
 
533 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  46.14 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.14 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.79 
 
 
570 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.14 
 
 
546 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
536 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  46.14 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  45.96 
 
 
546 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.14 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
540 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.98 
 
 
540 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  45.66 
 
 
579 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.66 
 
 
470 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
563 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.45 
 
 
573 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
579 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.06 
 
 
555 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1806  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.18 
 
 
652 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.95 
 
 
661 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.01 
 
 
572 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.23 
 
 
555 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.02 
 
 
570 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.84 
 
 
574 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
557 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
557 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.2 
 
 
651 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
559 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
546 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1716  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.43 
 
 
541 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0288519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.48 
 
 
560 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 
555 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.41 
 
 
642 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2081  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.67 
 
 
668 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.622232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.68 
 
 
573 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.48 
 
 
560 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
567 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1744  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.52 
 
 
535 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.693576  normal  0.460124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>