More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3700 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  98.92 
 
 		 551 aa  1059    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.92 
 
 		 551 aa  1060    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  98.92 
 
 		 551 aa  1059    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  99.46 
 
 		 554 aa  1110    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.64 
 
 		 561 aa  668    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  87.18 
 
 		 553 aa  907    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  86.82 
 
 		 553 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.84 
 
 		 586 aa  914    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.08 
 
 		 557 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.99 
 
 		 561 aa  652    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  99.46 
 
 		 554 aa  1109    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  67.08 
 
 		 557 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.23 
 
 		 562 aa  667    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.31 
 
 		 566 aa  672    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.74 
 
 		 551 aa  1055    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  67.08 
 
 		 557 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.92 
 
 		 557 aa  1048    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 554 aa  1117    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  99.46 
 
 		 554 aa  1109    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.58 
 
 		 556 aa  722    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  87 
 
 		 553 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  87 
 
 		 553 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.84 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.84 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.84 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.99 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.84 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.84 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  57.84 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.99 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 		 555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.78 
 
 		 553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.99 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.63 
 
 		 553 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.66 
 
 		 553 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.48 
 
 		 553 aa  568  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.91 
 
 		 562 aa  548  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.9 
 
 		 556 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 		 552 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  53.14 
 
 		 547 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.32 
 
 		 547 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.14 
 
 		 547 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.32 
 
 		 549 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.96 
 
 		 547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.78 
 
 		 547 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.45 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.87 
 
 		 556 aa  485  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  53.98 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  53.98 
 
 		 536 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  50.94 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.34 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  47.48 
 
 		 533 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  46.8 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.7 
 
 		 533 aa  432  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  46.52 
 
 		 533 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  46.7 
 
 		 533 aa  432  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  46.62 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  46.9 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  46.33 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  46.33 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.31 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.34 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  69.03 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.79 
 
 		 567 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.22 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 		 536 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.63 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.61 
 
 		 578 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.72 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.3 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.17 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.94 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.32 
 
 		 564 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 		 572 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 		 546 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 		 661 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  46.94 
 
 		 579 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.79 
 
 		 470 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  47.57 
 
 		 546 aa  362  9e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 		 546 aa  362  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  47.57 
 
 		 546 aa  362  9e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 		 573 aa  362  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.57 
 
 		 546 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.83 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.57 
 
 		 546 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.48 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.35 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 		 567 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.601659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 		 547 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>