More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1298 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  99.46 
 
 
553 aa  1121    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.46 
 
 
553 aa  1121    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.52 
 
 
553 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.88 
 
 
553 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  98.92 
 
 
553 aa  1115    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  99.46 
 
 
553 aa  1121    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  98.92 
 
 
553 aa  1115    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.89 
 
 
555 aa  784    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  99.46 
 
 
553 aa  1121    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.7 
 
 
553 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  78.7 
 
 
553 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.46 
 
 
553 aa  1121    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  72.2 
 
 
472 aa  705    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  100 
 
 
553 aa  1127    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  79.06 
 
 
553 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.73 
 
 
566 aa  588  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.68 
 
 
556 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  58.02 
 
 
551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.02 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  57.81 
 
 
557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.27 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  58.02 
 
 
551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.84 
 
 
551 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.84 
 
 
554 aa  581  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.09 
 
 
554 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  57.84 
 
 
551 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.02 
 
 
586 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.16 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.6 
 
 
553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.6 
 
 
553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.32 
 
 
553 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  58.5 
 
 
553 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  57.04 
 
 
557 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.74 
 
 
561 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.22 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  57.22 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.98 
 
 
561 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.24 
 
 
552 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.94 
 
 
562 aa  515  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.97 
 
 
547 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  53.15 
 
 
547 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.15 
 
 
547 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.79 
 
 
547 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.79 
 
 
547 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.79 
 
 
549 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.64 
 
 
556 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.25 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  51.64 
 
 
536 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  51.64 
 
 
536 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.28 
 
 
541 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.69 
 
 
556 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
575 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
567 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  48.17 
 
 
533 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  48.17 
 
 
533 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  47.78 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.98 
 
 
533 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  47.98 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  47.98 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  47.98 
 
 
533 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  47.78 
 
 
533 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  47.87 
 
 
533 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  47.78 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.29 
 
 
570 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
540 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
536 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  42.93 
 
 
546 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
546 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  42.93 
 
 
546 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.73 
 
 
540 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
568 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  42.93 
 
 
546 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  42.93 
 
 
546 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.44 
 
 
579 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  59.44 
 
 
579 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
563 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.72 
 
 
573 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
546 aa  382  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  42.93 
 
 
546 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.77 
 
 
661 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 
642 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1806  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.43 
 
 
652 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.5 
 
 
555 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
559 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.23 
 
 
572 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 
557 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.46 
 
 
651 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0034  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.07 
 
 
649 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4122  methyl-accepting chemotaxis protein  57.07 
 
 
649 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.88 
 
 
546 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  60.88 
 
 
470 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.15 
 
 
555 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2081  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.73 
 
 
668 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.622232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.06 
 
 
574 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.11 
 
 
567 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.64 
 
 
570 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 
560 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.11 
 
 
583 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 
555 aa  363  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880863  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.3 
 
 
573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>