More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1753 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  67.32 
 
 		 551 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.15 
 
 		 551 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.46 
 
 		 562 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 557 aa  1129    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  67.32 
 
 		 551 aa  699    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 557 aa  1129    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.2 
 
 		 556 aa  755    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  67.08 
 
 		 554 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  68.76 
 
 		 553 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  67.26 
 
 		 554 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.3 
 
 		 586 aa  715    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  67.26 
 
 		 554 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  67.32 
 
 		 551 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.49 
 
 		 566 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.08 
 
 		 554 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.99 
 
 		 561 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  99.64 
 
 		 557 aa  1126    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  66.9 
 
 		 557 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  68.76 
 
 		 553 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  68.94 
 
 		 553 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  68.76 
 
 		 553 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.36 
 
 		 561 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.41 
 
 		 555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.47 
 
 		 553 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.22 
 
 		 553 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.29 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.29 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.29 
 
 		 553 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.29 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.69 
 
 		 562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.22 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.22 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  57.22 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  57.22 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  56.61 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.22 
 
 		 553 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  56.68 
 
 		 553 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.51 
 
 		 556 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.27 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.91 
 
 		 552 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  51.43 
 
 		 547 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.43 
 
 		 547 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.61 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.43 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.06 
 
 		 549 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.07 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  54.32 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  54.32 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.07 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  53.04 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.98 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  48.17 
 
 		 533 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  47.98 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  48.17 
 
 		 533 aa  452  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  47.59 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  47.78 
 
 		 533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  47.78 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  47.78 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  47.59 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  48.65 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.91 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 		 570 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.84 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 		 567 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  45.79 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.84 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  46.94 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.94 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  46.94 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.1 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  50.46 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.55 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 		 574 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.98 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.01 
 
 		 651 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.04 
 
 		 628 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.42 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.77 
 
 		 559 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.06 
 
 		 642 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 		 536 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 		 546 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 		 557 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.31 
 
 		 570 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.56 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.48 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1806  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.49 
 
 		 652 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1716  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.07 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0288519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1804  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.07 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4122  methyl-accepting chemotaxis protein  56.2 
 
 		 649 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>