More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4786 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  86.8 
 
 
551 aa  928    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.44 
 
 
551 aa  924    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  87 
 
 
554 aa  920    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  87 
 
 
554 aa  920    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.13 
 
 
561 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.64 
 
 
586 aa  915    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.36 
 
 
562 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  100 
 
 
553 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.82 
 
 
554 aa  917    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.43 
 
 
566 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.71 
 
 
561 aa  683    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.76 
 
 
557 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.73 
 
 
553 aa  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  68.76 
 
 
557 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  68.76 
 
 
557 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  86.54 
 
 
557 aa  914    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.89 
 
 
556 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  86.64 
 
 
554 aa  917    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.73 
 
 
553 aa  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  86.62 
 
 
551 aa  925    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.92 
 
 
553 aa  1102    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  86.8 
 
 
551 aa  928    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.53 
 
 
555 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.78 
 
 
553 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.82 
 
 
553 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.82 
 
 
553 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.82 
 
 
553 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.64 
 
 
553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.82 
 
 
553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.78 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.78 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  58.78 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.78 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.78 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.6 
 
 
553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  58.24 
 
 
553 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.89 
 
 
552 aa  544  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.96 
 
 
549 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.38 
 
 
562 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 
556 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.29 
 
 
547 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  54.29 
 
 
547 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.29 
 
 
547 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.11 
 
 
547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.93 
 
 
547 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  54.51 
 
 
536 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  54.51 
 
 
536 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.4 
 
 
556 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.51 
 
 
541 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.24 
 
 
556 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  49.63 
 
 
533 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  46.47 
 
 
533 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  46.28 
 
 
533 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  46.47 
 
 
533 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  46.1 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  45.91 
 
 
533 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  46.36 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  46.36 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  46.55 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  73.82 
 
 
472 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.75 
 
 
575 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.38 
 
 
567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 
540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.8 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.5 
 
 
555 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.05 
 
 
555 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
570 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.74 
 
 
574 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.27 
 
 
661 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
536 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 
546 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.95 
 
 
561 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 
560 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 
579 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 
578 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  58.42 
 
 
579 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.59 
 
 
573 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.15 
 
 
573 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
557 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 
559 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.3 
 
 
572 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.06 
 
 
560 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.76 
 
 
580 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 
557 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
563 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.83 
 
 
569 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
567 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
570 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.58 
 
 
642 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.39 
 
 
470 aa  365  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  48.16 
 
 
546 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
546 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  48.16 
 
 
546 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.16 
 
 
546 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1806  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.5 
 
 
652 aa  363  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.09 
 
 
559 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 
546 aa  362  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  47.61 
 
 
546 aa  362  9e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.16 
 
 
546 aa  362  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>