More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1620 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 559 aa  1109    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.36 
 
 		 559 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.14 
 
 		 569 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.17 
 
 		 583 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  56.58 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.43 
 
 		 581 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.32 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.23 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.18 
 
 		 572 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.46 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.06 
 
 		 595 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.6 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.34 
 
 		 552 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.19 
 
 		 580 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.22 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.88 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 		 586 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.5 
 
 		 592 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.18 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 		 551 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.92 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 		 537 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.2 
 
 		 584 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.8 
 
 		 620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  63.48 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.66 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 		 560 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.91 
 
 		 650 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.99 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 589 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 549 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.41 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.87 
 
 		 598 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.05 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 		 591 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.98 
 
 		 591 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.15 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 		 596 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 589 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  73.17 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.8 
 
 		 585 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.68 
 
 		 602 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.08 
 
 		 585 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.03 
 
 		 680 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.08 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.27 
 
 		 587 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.2 
 
 		 520 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70 
 
 		 529 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.017789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.93 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129873  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 		 548 aa  385  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.06 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.98 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.69 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.66 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 		 589 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678642  normal  0.0204532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.52 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  49.8 
 
 		 608 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.35 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3180  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.12 
 
 		 522 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.94 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.547249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.52 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00689697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.75 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 		 559 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.16 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.69 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4332  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.92 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 		 622 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.65 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000862286  decreased coverage  0.00394801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  59.83 
 
 		 557 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.75 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  59.83 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.92 
 
 		 554 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  68.63 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  56.27 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  62.13 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  46.51 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  48 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.69 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.69 
 
 		 554 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>