More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4186 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 577 aa  1145    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.22 
 
 		 559 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.73 
 
 		 516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.29 
 
 		 559 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.98 
 
 		 579 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.79 
 
 		 581 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.66 
 
 		 583 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.74 
 
 		 595 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.33 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.61 
 
 		 551 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.78 
 
 		 551 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.6 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.21 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.64 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 		 572 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.12 
 
 		 592 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.8 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  83.18 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 542 aa  465  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.06 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  51.3 
 
 		 586 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 		 620 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 		 580 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.42 
 
 		 680 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 		 584 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.84 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.01 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.31 
 
 		 650 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.07 
 
 		 591 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.68 
 
 		 592 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.49 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 553 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 		 554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  64.4 
 
 		 559 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.78 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  45.27 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.36 
 
 		 550 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 		 554 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.76 
 
 		 587 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.15 
 
 		 584 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.15 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 		 579 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 		 553 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.51 
 
 		 615 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.51 
 
 		 615 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.45 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 		 584 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2474  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.21 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  52.56 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  52.56 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.43 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 		 602 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  69.26 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  49.52 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.24 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.547249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.98 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 		 554 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.19 
 
 		 522 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.19 
 
 		 522 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.72 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  54.7 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  54.7 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  61.4 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.56 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00034667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.04 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.54 
 
 		 532 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.35 
 
 		 651 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.4 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  61.09 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.12 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.78 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  54.7 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  54.7 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.74 
 
 		 589 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.98 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  60.85 
 
 		 733 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.3 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  55.47 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2762  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>