More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4183 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 516 aa  1022    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.73 
 
 		 577 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.1 
 
 		 559 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.22 
 
 		 579 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.02 
 
 		 581 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.14 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  56.67 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.22 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.06 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.12 
 
 		 552 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.65 
 
 		 569 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.04 
 
 		 592 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.59 
 
 		 525 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.92 
 
 		 620 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 		 551 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.18 
 
 		 523 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  54.9 
 
 		 586 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  87.54 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.77 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 		 580 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.68 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.73 
 
 		 650 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.06 
 
 		 680 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.92 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.44 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.68 
 
 		 579 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  46.69 
 
 		 543 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 		 589 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.94 
 
 		 585 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.51 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.74 
 
 		 596 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 		 553 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.01 
 
 		 587 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 		 537 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.18 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.18 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 		 591 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.56 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.81 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 		 589 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.81 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 		 597 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 575 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 		 548 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  69.16 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  70.32 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.93 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 		 570 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.23 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.24 
 
 		 529 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.017789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.31 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.67 
 
 		 602 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 		 566 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.18 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.274613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.1 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 554 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.68 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.22 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  66.22 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.61 
 
 		 622 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.05 
 
 		 605 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  47.05 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  66.45 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 		 554 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  65.88 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.05 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0449  methyl-accepting chemotaxis protein  47.94 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.123732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 557 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 		 561 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 		 573 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 		 589 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678642  normal  0.0204532 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  46.86 
 
 		 565 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  46.86 
 
 		 565 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  46.86 
 
 		 565 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.75 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  46.86 
 
 		 562 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.46 
 
 		 581 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 		 589 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  67.09 
 
 		 600 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.8 
 
 		 471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00689697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.39 
 
 		 630 aa  362  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.86 
 
 		 562 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 		 605 aa  362  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>