More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4174 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  86.59 
 
 		 524 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 522 aa  1042    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 522 aa  1042    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 615 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.34 
 
 		 615 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  55.49 
 
 		 608 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  55.68 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.63 
 
 		 608 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.63 
 
 		 608 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.49 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  74.19 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 		 570 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 618 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 		 617 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 		 605 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2799  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  74.7 
 
 		 515 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00825356  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.05 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_003296  RS02605  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  81.88 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414906  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  52.33 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.82 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  81.82 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.05 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  49.9 
 
 		 673 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  50.1 
 
 		 673 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.85 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4163  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.05 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  49.71 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.19 
 
 		 671 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 		 648 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  68.67 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.49 
 
 		 655 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 		 659 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 		 547 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 		 559 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.52 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  49.42 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.92 
 
 		 583 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  49.22 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.88 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.9 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 		 659 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.29 
 
 		 657 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 		 659 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.91 
 
 		 594 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  70.39 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.88 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.89 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.44 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 		 601 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.72 
 
 		 552 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3683  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 		 613 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.755698  normal  0.0578518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  74.48 
 
 		 617 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 		 521 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.39 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.78 
 
 		 608 aa  365  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.56 
 
 		 587 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.11 
 
 		 578 aa  363  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.69 
 
 		 566 aa  363  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.86 
 
 		 580 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 		 567 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.79 
 
 		 598 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.82 
 
 		 550 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.48 
 
 		 609 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  67.43 
 
 		 586 aa  362  9e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.84 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.12 
 
 		 580 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  65.88 
 
 		 705 aa  359  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.12 
 
 		 542 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.5 
 
 		 650 aa  359  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.98 
 
 		 587 aa  359  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.71 
 
 		 592 aa  358  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.23 
 
 		 562 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  66.56 
 
 		 566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  48.64 
 
 		 518 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.76 
 
 		 569 aa  356  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 		 529 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 		 539 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  48.25 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  48.25 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.03 
 
 		 520 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  48.25 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  47.03 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.78 
 
 		 584 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  46.98 
 
 		 536 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.02 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  46.98 
 
 		 536 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.36 
 
 		 598 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>