More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2972 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.96 
 
 		 617 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  67.57 
 
 		 673 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  67.57 
 
 		 673 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.09 
 
 		 655 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  67.57 
 
 		 673 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 597 aa  1182    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  67.57 
 
 		 673 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 		 618 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.27 
 
 		 657 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  67.57 
 
 		 671 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.08 
 
 		 659 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.46 
 
 		 659 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.5 
 
 		 648 aa  688    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.46 
 
 		 659 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  67.57 
 
 		 673 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  67.76 
 
 		 673 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.66 
 
 		 648 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  65.49 
 
 		 666 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.2 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.2 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 567 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  51.59 
 
 		 600 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 		 547 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  50.6 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.52 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.74 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  44.59 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.28 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.28 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 		 539 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.79 
 
 		 559 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.9 
 
 		 601 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 		 605 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  65.95 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.16 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00034667 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.59 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  49.81 
 
 		 616 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.13 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 		 575 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  48.78 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.39 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947036  normal  0.198959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.08 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0431  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4195  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.93 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.67 
 
 		 578 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.25 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 519 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  64.53 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.45 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.53 
 
 		 557 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  64.53 
 
 		 557 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 		 536 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 		 522 aa  359  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 		 540 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 		 559 aa  359  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 555 aa  359  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880863  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.6 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  62.92 
 
 		 551 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.83 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.6 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.6 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  59.6 
 
 		 553 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000944533  normal  0.933191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 		 519 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.58 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 		 519 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 		 529 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 		 519 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 		 535 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 		 519 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 		 555 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 		 587 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.26 
 
 		 598 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.47 
 
 		 513 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.97 
 
 		 580 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>