More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0171 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.5 
 
 		 657 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.99 
 
 		 648 aa  1073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  80.31 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.76 
 
 		 659 aa  961    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  80.5 
 
 		 673 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.26 
 
 		 655 aa  1011    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  80.31 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  81 
 
 		 666 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  80.69 
 
 		 673 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.52 
 
 		 618 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  80.31 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.64 
 
 		 659 aa  946    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 648 aa  1284    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.64 
 
 		 659 aa  946    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  80.5 
 
 		 671 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.66 
 
 		 597 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.15 
 
 		 617 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  80.31 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.38 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 567 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 		 547 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  50.57 
 
 		 600 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.78 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.78 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.94 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  43.44 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.98 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  49.52 
 
 		 524 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0431  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 616 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 		 522 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  66.98 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.36 
 
 		 595 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  47.7 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  48.77 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 		 572 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 		 601 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 		 562 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  47.62 
 
 		 626 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.62 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.82 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.27 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27960  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 		 575 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  48.09 
 
 		 621 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 		 516 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  61.03 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  61.03 
 
 		 557 aa  365  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 		 570 aa  365  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.03 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 		 596 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 		 519 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 		 519 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 		 519 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 		 519 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.66 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000944533  normal  0.933191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 		 540 aa  361  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 519 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947036  normal  0.198959 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 559 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 		 540 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 		 573 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.92 
 
 		 541 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 		 557 aa  356  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  47.14 
 
 		 518 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  47.14 
 
 		 518 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 518 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  47.14 
 
 		 518 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 594 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.61 
 
 		 513 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 		 556 aa  353  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 		 561 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 		 579 aa  353  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 		 532 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.62 
 
 		 591 aa  352  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.65 
 
 		 580 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 		 567 aa  352  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 		 559 aa  351  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.77 
 
 		 569 aa  350  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.44 
 
 		 588 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.44 
 
 		 588 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>