More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3678 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.59 
 
 		 570 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 605 aa  1209    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  54.44 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.8 
 
 		 608 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.8 
 
 		 608 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  48.46 
 
 		 608 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 		 615 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 		 615 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.51 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.41 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 		 601 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.53 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.75 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  52.83 
 
 		 515 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.85 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.06 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.79 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  50.59 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  50.96 
 
 		 616 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  50.31 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.31 
 
 		 634 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  50.31 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  52.12 
 
 		 626 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  50.31 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  52.12 
 
 		 621 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 		 587 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.75 
 
 		 595 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.24 
 
 		 617 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  49.69 
 
 		 530 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  49.69 
 
 		 530 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.22 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  49.69 
 
 		 530 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.45 
 
 		 655 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  54.88 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.46 
 
 		 612 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.83 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.65 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.83 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 		 579 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  69.23 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.44 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 		 589 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.74 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  65.34 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.8 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.864566 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.66 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 		 657 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.76 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.7 
 
 		 594 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.05 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 659 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.41 
 
 		 587 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 659 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.61 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.88 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 		 542 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.08 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  47.46 
 
 		 673 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.28 
 
 		 673 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.03 
 
 		 666 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.08 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  47.28 
 
 		 671 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.08 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.08 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.44 
 
 		 595 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.65 
 
 		 567 aa  365  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 		 578 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.82 
 
 		 542 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 		 573 aa  361  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.1 
 
 		 650 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  55.47 
 
 		 586 aa  359  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 		 580 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 567 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.1 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.76 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 		 589 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 		 569 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 		 575 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>