More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4189 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 559 aa  1103    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.31 
 
 		 577 aa  555  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.36 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.1 
 
 		 516 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.96 
 
 		 569 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.81 
 
 		 583 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.04 
 
 		 581 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.04 
 
 		 579 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.31 
 
 		 595 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.14 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.58 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.79 
 
 		 513 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.18 
 
 		 542 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.12 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.1 
 
 		 680 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 		 578 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.51 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.2 
 
 		 551 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.71 
 
 		 579 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  54.15 
 
 		 586 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 		 580 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.95 
 
 		 620 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.21 
 
 		 584 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 		 591 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 		 554 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.89 
 
 		 650 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 		 589 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  77.29 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.62 
 
 		 591 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  47.81 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.81 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.81 
 
 		 433 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 		 592 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 		 559 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.78 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 		 584 aa  409  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.33 
 
 		 585 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 		 596 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 		 561 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.2 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.19 
 
 		 605 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.18 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1955  methyl-accepting chemotaxis protein  49.15 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.53 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  48.26 
 
 		 562 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.46 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52 
 
 		 580 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  48.26 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.87 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  48.39 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.46 
 
 		 589 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678642  normal  0.0204532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.46 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.9 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  48.2 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  66.33 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  48.2 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.17 
 
 		 541 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.28 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.9 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  48.2 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  66.67 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  62.04 
 
 		 752 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 		 537 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000862286  decreased coverage  0.00394801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59 
 
 		 628 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.96 
 
 		 584 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 		 602 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.96 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  66.56 
 
 		 608 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.36 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3180  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.11 
 
 		 755 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.46 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.4 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129873  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>