More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1622 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 572 aa  1133    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  86.98 
 
 		 559 aa  578  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  57.94 
 
 		 586 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.18 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.83 
 
 		 579 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 		 596 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.7 
 
 		 589 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 		 559 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 		 535 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 		 532 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.69 
 
 		 569 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.41 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  49.14 
 
 		 608 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.89 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.3 
 
 		 595 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 		 615 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 		 615 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.81 
 
 		 592 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.24 
 
 		 650 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.53 
 
 		 605 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.86 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  50.29 
 
 		 600 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.49 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  66.05 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.07 
 
 		 537 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.68 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  55.64 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.49 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.61 
 
 		 591 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.6 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.67 
 
 		 680 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.92 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  50 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 		 595 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.63 
 
 		 579 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.61 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 617 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  54.7 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.73 
 
 		 560 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.67 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  67.8 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.13 
 
 		 673 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.44 
 
 		 550 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.71 
 
 		 591 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.13 
 
 		 673 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.87 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.32 
 
 		 673 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  48.32 
 
 		 671 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.79 
 
 		 666 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.13 
 
 		 673 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 		 618 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.13 
 
 		 673 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.73 
 
 		 579 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.62 
 
 		 755 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  48.32 
 
 		 673 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.67 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  48.37 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3659  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 		 550 aa  379  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.39 
 
 		 584 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00034667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  54.32 
 
 		 733 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  48.96 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.46 
 
 		 589 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 		 508 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  70.62 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  62.9 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 		 612 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.61 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 		 659 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.51 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.017789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.31 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 		 580 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.8 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 		 659 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 		 657 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 		 659 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.51 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  62.39 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.79 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 		 594 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>