More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0687 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 433 aa  847    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.92 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.47 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.84 
 
 		 579 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.92 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.56 
 
 		 680 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.57 
 
 		 577 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  61.74 
 
 		 586 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  63.88 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.92 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.21 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.55 
 
 		 569 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.69 
 
 		 591 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.79 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.42 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.48 
 
 		 583 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.44 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 		 596 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5413  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.11 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.37 
 
 		 591 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  59.08 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.37 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.17 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.88 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.06 
 
 		 755 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.22 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.59 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.18 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.193658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.45 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.76 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.23 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.51 
 
 		 584 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.16 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 		 580 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.67 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.6 
 
 		 527 aa  365  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.98 
 
 		 595 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 		 578 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.89 
 
 		 615 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.89 
 
 		 615 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.84 
 
 		 598 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.26 
 
 		 554 aa  362  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.547249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.84 
 
 		 587 aa  362  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.33 
 
 		 575 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.04 
 
 		 589 aa  362  9e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.24 
 
 		 597 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.4 
 
 		 621 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.203772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.15 
 
 		 745 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.91 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1155  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  68.24 
 
 		 629 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.852924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.91 
 
 		 581 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.33 
 
 		 581 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  64.71 
 
 		 797 aa  359  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.43 
 
 		 365 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  62.61 
 
 		 551 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.86 
 
 		 560 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.05 
 
 		 552 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.84 
 
 		 587 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.86 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  59.94 
 
 		 705 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  57.88 
 
 		 752 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.03 
 
 		 552 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00034667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.66 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.15 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.53 
 
 		 585 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.44 
 
 		 499 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  58.03 
 
 		 733 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.53 
 
 		 573 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.06 
 
 		 618 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.34 
 
 		 740 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.6 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.28 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  59.08 
 
 		 584 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.9 
 
 		 793 aa  352  8e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  63.09 
 
 		 608 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.52 
 
 		 566 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.35 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.61 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00689697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  54.57 
 
 		 557 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.57 
 
 		 557 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.77 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64 
 
 		 522 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64 
 
 		 522 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.13 
 
 		 602 aa  349  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.87 
 
 		 562 aa  348  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  54.29 
 
 		 557 aa  348  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.63 
 
 		 630 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.58 
 
 		 515 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.23 
 
 		 628 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.04 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00046  chemotaxis protein  57.46 
 
 		 753 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.49 
 
 		 584 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  63.47 
 
 		 600 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4163  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.16 
 
 		 634 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.16 
 
 		 634 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.26 
 
 		 515 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 		 562 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.8 
 
 		 555 aa  346  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>