More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4185 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 579 aa  1143    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.17 
 
 		 594 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3683  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.23 
 
 		 613 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.755698  normal  0.0578518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.42 
 
 		 634 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4163  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.42 
 
 		 634 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 		 559 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.39 
 
 		 680 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 573 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22826  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  76.63 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.62 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.84 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  66.3 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.15 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.51 
 
 		 577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.32 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 		 589 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 		 544 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.170651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 		 581 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.03 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.68 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.98 
 
 		 515 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  66.67 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.38 
 
 		 621 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.203772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.87 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.28 
 
 		 578 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1155  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  70.06 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.852924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2799  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  66.67 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00825356  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.46 
 
 		 583 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 		 650 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 		 576 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448898  normal  0.153923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.5368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.61 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.7 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.310324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.81 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.89 
 
 		 755 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  59.49 
 
 		 585 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  57.95 
 
 		 616 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 		 793 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  68.57 
 
 		 797 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  57.95 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  57.95 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  66.77 
 
 		 752 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  57.95 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.89 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  57.95 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.31 
 
 		 578 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.274613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.82 
 
 		 745 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.6 
 
 		 595 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  57.95 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2374  methyl-accepting chemotaxis protein  64.35 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  65.09 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1797  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  64.78 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00249048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2548  methyl-accepting chemotaxis protein  60.45 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00975221  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.58 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.58 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  64.54 
 
 		 733 aa  364  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.27 
 
 		 592 aa  363  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  64.13 
 
 		 580 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  45.7 
 
 		 562 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  61.03 
 
 		 705 aa  363  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 		 584 aa  362  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.31 
 
 		 740 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02605  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  70.03 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414906  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 		 575 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  61.9 
 
 		 557 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.9 
 
 		 557 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  45.7 
 
 		 562 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  59.32 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000712436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 560 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.69 
 
 		 579 aa  360  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.69 
 
 		 581 aa  360  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 		 596 aa  360  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  60.28 
 
 		 775 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  61.59 
 
 		 557 aa  359  8e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.99 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.62 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 		 591 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  46.14 
 
 		 565 aa  357  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  46.14 
 
 		 565 aa  357  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  46.14 
 
 		 565 aa  357  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 		 580 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 		 557 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>