More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0660 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 586 aa  1158    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.33 
 
 		 572 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  58.47 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.68 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.05 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.22 
 
 		 569 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.34 
 
 		 537 aa  435  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.6 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.7 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.53 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 553 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.39 
 
 		 583 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 		 554 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 		 584 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  50.1 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 		 580 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 		 595 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4047  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928828 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  45.81 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 		 589 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 		 605 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.5 
 
 		 591 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 		 560 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.85 
 
 		 591 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.35 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 		 579 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.74 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.8 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.66 
 
 		 650 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.68 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.69 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  46.19 
 
 		 562 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  66.23 
 
 		 557 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.19 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 		 548 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.68 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.14 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.08 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.88 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 550 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 		 554 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.13 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.55 
 
 		 680 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 		 554 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0335  methyl-accepting chemotaxis protein I  65.2 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.809135  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.91 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.310324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 		 596 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  60.64 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.04 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  47.04 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  47.04 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.49 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.85 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  47.04 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  47.04 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  62.84 
 
 		 733 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.08 
 
 		 584 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0449  methyl-accepting chemotaxis protein  46.08 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.123732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.44 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 		 620 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.04 
 
 		 755 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.58 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  69.91 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.85 
 
 		 584 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  66.34 
 
 		 752 aa  364  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  53.35 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 		 554 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0129  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.36 
 
 		 511 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2474  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 		 552 aa  363  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.31 
 
 		 615 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2548  methyl-accepting chemotaxis protein  48.85 
 
 		 525 aa  362  8e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00975221  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.31 
 
 		 615 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 599 aa  362  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 		 551 aa  362  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 		 551 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  65.62 
 
 		 797 aa  362  9e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  66.67 
 
 		 705 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 		 573 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 		 622 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>