More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3464 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.56 
 
 		 551 aa  995    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 551 aa  1097    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.98 
 
 		 523 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.13 
 
 		 508 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.3 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.43 
 
 		 583 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.99 
 
 		 581 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.62004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.19 
 
 		 579 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.27 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.59 
 
 		 577 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.72 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 		 552 aa  465  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.28 
 
 		 595 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.2 
 
 		 559 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 		 569 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.75 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.76 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244601  normal  0.213177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.05 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.47 
 
 		 592 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 		 584 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  42.8 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 		 555 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.25 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 		 592 aa  362  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  44.91 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 		 549 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.13 
 
 		 550 aa  357  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 		 540 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4047  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2474  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.01 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 		 549 aa  355  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 560 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.14 
 
 		 642 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.0148687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4454  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.4 
 
 		 653 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 		 589 aa  347  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.04 
 
 		 535 aa  346  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.76 
 
 		 598 aa  346  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 		 650 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.54 
 
 		 622 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.79 
 
 		 653 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.79 
 
 		 653 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 		 511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 		 584 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 		 653 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0240769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.29 
 
 		 653 aa  343  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.5 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4446  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 605 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0260008  normal  0.622584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 596 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.36 
 
 		 661 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.3 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.3 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.61 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.64 
 
 		 548 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 		 567 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 		 651 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 605 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 560 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.718562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.33 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.32 
 
 		 546 aa  336  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.53 
 
 		 585 aa  335  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2762  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 		 584 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 589 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.83 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 589 aa  334  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  41.19 
 
 		 562 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 584 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 		 586 aa  333  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 		 635 aa  333  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  46.08 
 
 		 546 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  46.08 
 
 		 546 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 		 546 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  46.08 
 
 		 546 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 		 539 aa  332  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 		 587 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  41 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 		 562 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1838  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.52 
 
 		 667 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 499 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.923818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.67 
 
 		 659 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.51 
 
 		 584 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 555 aa  330  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.49 
 
 		 527 aa  329  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 		 570 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  45.61 
 
 		 546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>