More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3949 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  99.27 
 
 
547 aa  1093    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  100 
 
 
547 aa  1103    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.9 
 
 
547 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  99.09 
 
 
547 aa  1090    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  98.9 
 
 
547 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.09 
 
 
552 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  53.07 
 
 
551 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 
551 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.88 
 
 
556 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.89 
 
 
551 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  53.07 
 
 
551 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.79 
 
 
553 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  53.58 
 
 
553 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.96 
 
 
554 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.93 
 
 
553 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.96 
 
 
554 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.93 
 
 
553 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.76 
 
 
586 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.96 
 
 
554 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  53.58 
 
 
553 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  53.58 
 
 
553 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  53.58 
 
 
553 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  53.58 
 
 
553 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.78 
 
 
554 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.45 
 
 
562 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.02 
 
 
557 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.11 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.93 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 
566 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.98 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  51.29 
 
 
557 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.97 
 
 
553 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.97 
 
 
553 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.97 
 
 
553 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.17 
 
 
561 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  52.97 
 
 
553 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.65 
 
 
557 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.89 
 
 
561 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.97 
 
 
553 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  51.65 
 
 
557 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
555 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.61 
 
 
553 aa  485  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.79 
 
 
553 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.02 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.1 
 
 
556 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.26 
 
 
549 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
556 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.62 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  50.48 
 
 
536 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  50.48 
 
 
536 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  45.37 
 
 
533 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.07 
 
 
557 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.49 
 
 
567 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.45 
 
 
575 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
572 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.87 
 
 
559 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.28 
 
 
570 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  48.7 
 
 
546 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
546 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  48.7 
 
 
546 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  50.11 
 
 
533 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  50.11 
 
 
533 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  49.67 
 
 
470 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  69.97 
 
 
472 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 
563 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.7 
 
 
546 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.89 
 
 
533 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
574 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  49.89 
 
 
533 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.68 
 
 
579 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.83 
 
 
555 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.7 
 
 
546 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  49.89 
 
 
533 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 
546 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  49.26 
 
 
579 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.48 
 
 
546 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.83 
 
 
555 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  49.66 
 
 
533 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.7 
 
 
573 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1740  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.37 
 
 
541 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  49.66 
 
 
533 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  49.66 
 
 
533 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1531  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.37 
 
 
541 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  49.89 
 
 
533 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1804  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.37 
 
 
535 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1744  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.37 
 
 
535 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.693576  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1716  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.37 
 
 
541 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0288519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.35 
 
 
519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 
556 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
558 aa  362  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.13 
 
 
540 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.21 
 
 
560 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.57 
 
 
560 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.27 
 
 
661 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
570 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.04 
 
 
588 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 
576 aa  359  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
540 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.57 
 
 
567 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>