More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0904 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
515 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.79 
 
 
515 aa  881    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.76 
 
 
529 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.97 
 
 
539 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60428  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
516 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 
550 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 
521 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432254  normal  0.0511942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
521 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
521 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.877562  normal  0.90264 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 
521 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467964  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.85 
 
 
549 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
547 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.87 
 
 
549 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 
617 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
618 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
566 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
520 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.654315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
520 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 
522 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
648 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
521 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000360253  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 
522 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
655 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 
562 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
648 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
659 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
567 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 
597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
659 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
659 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
657 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27970  chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
575 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0997024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
572 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.77 
 
 
671 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.77 
 
 
673 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.26 
 
 
673 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.26 
 
 
673 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.26 
 
 
673 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  45.77 
 
 
673 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.26 
 
 
673 aa  346  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.17 
 
 
608 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.17 
 
 
608 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 
561 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
539 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
519 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
519 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
519 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
519 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  61.06 
 
 
513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
552 aa  339  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  50.24 
 
 
600 aa  339  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.31 
 
 
666 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 
561 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.75 
 
 
519 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 
538 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 
540 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
541 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51670  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 
566 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  46.15 
 
 
513 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 
514 aa  334  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756011  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.73 
 
 
601 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
567 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.88 
 
 
540 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
579 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  46.82 
 
 
524 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
588 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
562 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.9 
 
 
575 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  43.46 
 
 
579 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.09 
 
 
559 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.42 
 
 
583 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  43.95 
 
 
515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.14 
 
 
580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.64 
 
 
555 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
557 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  47.27 
 
 
557 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58 
 
 
549 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.36 
 
 
569 aa  326  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
513 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  47.27 
 
 
557 aa  326  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.32 
 
 
556 aa  326  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  47.57 
 
 
543 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
570 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  42.18 
 
 
536 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
605 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  42.18 
 
 
536 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.46 
 
 
661 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  44.4 
 
 
608 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 
557 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.28 
 
 
520 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  46.27 
 
 
518 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  46.27 
 
 
518 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  46.27 
 
 
518 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
554 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  46.27 
 
 
518 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  41.46 
 
 
533 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
551 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.76 
 
 
585 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 
536 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>