More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1156 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1860  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
537 aa  1068    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0534573  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.11 
 
 
539 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1744  methyl-accepting chemotaxis protein  99.26 
 
 
537 aa  1058    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.41 
 
 
539 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2180  methyl-accepting chemotaxis protein  97.08 
 
 
537 aa  952    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0470297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.9 
 
 
544 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.28 
 
 
539 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0392  methyl-accepting chemotaxis protein  99.25 
 
 
531 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.147858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0300  methyl-accepting chemotaxis protein  99.07 
 
 
537 aa  1058    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.06 
 
 
539 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.323965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.47 
 
 
541 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.06 
 
 
539 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2133  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
537 aa  1068    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0869  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
537 aa  1068    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1156  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
537 aa  1068    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.709617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.67 
 
 
540 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.29 
 
 
540 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.01 
 
 
536 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
541 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
562 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
566 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 
555 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.72 
 
 
553 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  47.23 
 
 
553 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  47.23 
 
 
553 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  45.64 
 
 
536 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.76 
 
 
553 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  45.64 
 
 
536 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
561 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  47.04 
 
 
553 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.1 
 
 
553 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
552 aa  363  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
561 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.32 
 
 
554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  43.46 
 
 
557 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
557 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  45.32 
 
 
551 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
551 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  45.32 
 
 
551 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  43.63 
 
 
557 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.32 
 
 
557 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.32 
 
 
554 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.32 
 
 
554 aa  355  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
556 aa  354  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  43.35 
 
 
533 aa  352  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  45.12 
 
 
551 aa  352  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.85 
 
 
553 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 
567 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.67 
 
 
553 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.67 
 
 
553 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.9 
 
 
553 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.9 
 
 
553 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
553 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  45.9 
 
 
553 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.9 
 
 
553 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
553 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.49 
 
 
553 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.71 
 
 
553 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
586 aa  347  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 
562 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  43.18 
 
 
533 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  40.69 
 
 
547 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  40.69 
 
 
547 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  40.51 
 
 
547 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  43.28 
 
 
533 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  40.51 
 
 
547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  40.33 
 
 
547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  43.1 
 
 
533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
533 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  43.2 
 
 
533 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  43.02 
 
 
533 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  43.21 
 
 
533 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  43.21 
 
 
533 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  42.91 
 
 
533 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 
556 aa  330  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.08 
 
 
546 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  41.91 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  41.91 
 
 
546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 
546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  41.91 
 
 
546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  41.91 
 
 
546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  41.72 
 
 
546 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
519 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 
546 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 
572 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4195  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 
515 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 
527 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.84 
 
 
552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 
549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 
519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  44.07 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.04 
 
 
542 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
555 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  42.47 
 
 
515 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
570 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
557 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.64 
 
 
596 aa  306  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.21 
 
 
555 aa  306  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>