More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1679 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
700 aa  1400    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  99.29 
 
 
700 aa  1395    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  52.92 
 
 
731 aa  703    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  92 
 
 
700 aa  1308    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  42.48 
 
 
694 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  50.87 
 
 
678 aa  443  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  51.08 
 
 
656 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  51.97 
 
 
657 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  60.48 
 
 
653 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  66.47 
 
 
660 aa  430  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  61.87 
 
 
658 aa  427  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  54.33 
 
 
540 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  46.64 
 
 
659 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  48.29 
 
 
651 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  46.34 
 
 
659 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  62.32 
 
 
664 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  45.08 
 
 
665 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  61.74 
 
 
662 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  43.05 
 
 
652 aa  369  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 
653 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
649 aa  360  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  43.1 
 
 
657 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  55 
 
 
545 aa  350  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  41.06 
 
 
596 aa  346  7e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  54.71 
 
 
544 aa  343  5e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  38.64 
 
 
655 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  38.64 
 
 
655 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  38.59 
 
 
663 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.24 
 
 
651 aa  303  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  37.6 
 
 
654 aa  300  8e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  46.26 
 
 
656 aa  296  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  64.83 
 
 
236 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  38.84 
 
 
654 aa  289  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  36.79 
 
 
604 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
663 aa  253  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  44.04 
 
 
553 aa  249  8e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.08 
 
 
796 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  27.18 
 
 
713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 
625 aa  142  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
627 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.82 
 
 
746 aa  134  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2502  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.83 
 
 
785 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.74 
 
 
749 aa  134  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726311  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.21 
 
 
778 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.28 
 
 
625 aa  133  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.47 
 
 
726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.37 
 
 
793 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.58 
 
 
630 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  29.05 
 
 
656 aa  130  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 
708 aa  129  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  26.49 
 
 
621 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
372 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 
658 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.7 
 
 
640 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 
659 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
530 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 
650 aa  126  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  35.74 
 
 
566 aa  125  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  26.48 
 
 
676 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  23.89 
 
 
632 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
633 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  26.94 
 
 
695 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 
357 aa  124  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2364  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.36 
 
 
702 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.18 
 
 
832 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.39 
 
 
630 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0912  methyl-accepting chemotaxis protein  36.55 
 
 
551 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0785  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
551 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367078  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05406  histidine kinase/response regulator hybrid protein  34.46 
 
 
666 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  25.29 
 
 
695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001468  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 
666 aa  122  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  25.05 
 
 
728 aa  122  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  22.34 
 
 
728 aa  122  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.15 
 
 
626 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  45.22 
 
 
661 aa  122  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  24.23 
 
 
629 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.39 
 
 
563 aa  122  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
421 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.59 
 
 
656 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.14 
 
 
659 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.261932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2361  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 
652 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.128072  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
702 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 
632 aa  120  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.45 
 
 
526 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  53.85 
 
 
431 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.28 
 
 
782 aa  120  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  23.33 
 
 
632 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  35.04 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.134066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.94 
 
 
628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.11 
 
 
554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  29.35 
 
 
538 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 
674 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000495749  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
537 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  42.86 
 
 
626 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  34.03 
 
 
542 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  47.55 
 
 
656 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 
546 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>