More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1499 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 
694 aa  1412    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  43.16 
 
 
700 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  43.3 
 
 
700 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  41.85 
 
 
700 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
731 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  36.48 
 
 
659 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  36.27 
 
 
659 aa  364  4e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  42 
 
 
678 aa  362  1e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  41.43 
 
 
653 aa  362  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  36.58 
 
 
657 aa  360  5e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  51.07 
 
 
656 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  42.17 
 
 
540 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  39.15 
 
 
664 aa  353  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  39.19 
 
 
665 aa  352  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  38.22 
 
 
653 aa  351  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  43.65 
 
 
660 aa  351  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  50.41 
 
 
658 aa  350  4e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  43.04 
 
 
652 aa  350  4e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  44.34 
 
 
596 aa  348  3e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  55.69 
 
 
544 aa  346  6e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  39.92 
 
 
662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  49.44 
 
 
651 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  53.64 
 
 
545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  37.61 
 
 
657 aa  338  2.9999999999999997e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  41.02 
 
 
663 aa  330  7e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
649 aa  325  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  50.41 
 
 
656 aa  320  5e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  47.49 
 
 
654 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.57 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 
655 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 
655 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  35.44 
 
 
654 aa  307  6e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  36.63 
 
 
604 aa  275  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 
663 aa  260  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  55.51 
 
 
236 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  44.74 
 
 
553 aa  243  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
372 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 
627 aa  127  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  36.52 
 
 
656 aa  126  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.48 
 
 
659 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 
621 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
625 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  26.48 
 
 
740 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.25 
 
 
832 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  49.64 
 
 
713 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
708 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3704  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.02 
 
 
559 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  34.23 
 
 
661 aa  120  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  24.48 
 
 
744 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  61.39 
 
 
566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.74 
 
 
658 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
941 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  54.7 
 
 
546 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
563 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
551 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
550 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3761  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 
557 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3844  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 
556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 
778 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.64 
 
 
959 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  49.64 
 
 
633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 
656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 
563 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.37 
 
 
707 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.81 
 
 
530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  62.37 
 
 
650 aa  114  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 
632 aa  114  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.04 
 
 
530 aa  114  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 
720 aa  113  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 
541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0151  methyl-accepting chemotaxis protein  29.9 
 
 
678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  26.13 
 
 
697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  31.99 
 
 
706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 
682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 
669 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  25.29 
 
 
695 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
533 aa  112  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 
357 aa  111  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  25.27 
 
 
712 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.89 
 
 
550 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.82 
 
 
630 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 
832 aa  111  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
637 aa  110  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0256  chemotaxis transducer  27.51 
 
 
679 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
720 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 
553 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1762  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 
553 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 
532 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 
561 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.834659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 
563 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 
635 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  25.13 
 
 
778 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  27.7 
 
 
648 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 
675 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>