More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0190 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  56.47 
 
 
653 aa  724    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  68.17 
 
 
596 aa  805    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  75.92 
 
 
652 aa  954    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  97.12 
 
 
545 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
657 aa  1323    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  80.69 
 
 
544 aa  523  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  43.2 
 
 
660 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  41.35 
 
 
653 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  41.74 
 
 
665 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
649 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  42.08 
 
 
664 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  41.82 
 
 
658 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  41.88 
 
 
662 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  38.37 
 
 
654 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  39.91 
 
 
678 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  39.26 
 
 
657 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  39.01 
 
 
659 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  39.31 
 
 
659 aa  429  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  39.82 
 
 
656 aa  426  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  39.86 
 
 
655 aa  425  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  39.86 
 
 
655 aa  425  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  36.88 
 
 
663 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  43.84 
 
 
540 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  41.25 
 
 
651 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  41.3 
 
 
604 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 
700 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  43.1 
 
 
700 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  42.53 
 
 
700 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  42.21 
 
 
731 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  37.5 
 
 
694 aa  361  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  36.71 
 
 
654 aa  360  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48.45 
 
 
651 aa  333  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  50 
 
 
656 aa  331  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  47.58 
 
 
553 aa  277  4e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  58.05 
 
 
236 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 
663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 
625 aa  220  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 
633 aa  199  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  27.65 
 
 
621 aa  196  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  27.9 
 
 
627 aa  186  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.05 
 
 
632 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.56 
 
 
658 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 
625 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.83 
 
 
631 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.89 
 
 
657 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 
636 aa  163  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
622 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.02 
 
 
660 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  25.54 
 
 
660 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  25.99 
 
 
660 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.96 
 
 
626 aa  160  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.67 
 
 
609 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.45 
 
 
626 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.03 
 
 
629 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  25.27 
 
 
660 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.27 
 
 
660 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  25.27 
 
 
660 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  25.27 
 
 
660 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  25.27 
 
 
660 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  24.63 
 
 
623 aa  158  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.15 
 
 
643 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  26.47 
 
 
629 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  24.79 
 
 
630 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.34 
 
 
608 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 
628 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  26.29 
 
 
629 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  25.46 
 
 
629 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.92 
 
 
660 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.87 
 
 
660 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.53 
 
 
698 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.55 
 
 
627 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.83 
 
 
628 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2894  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  25.57 
 
 
605 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.96 
 
 
599 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  25.98 
 
 
601 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  25.79 
 
 
629 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 
656 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3471  putative methyl-accepting chemotaxis protein  25.41 
 
 
605 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3975  methyl-accepting chemotaxis protein  25.37 
 
 
601 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0112  putative methyl-accepting chemotaxis protein  25.37 
 
 
605 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3894  methyl-accepting chemotaxis protein  25.37 
 
 
601 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0518753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.11 
 
 
622 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.71 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 
630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 
660 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.08 
 
 
596 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  25.66 
 
 
622 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
630 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  25.63 
 
 
658 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
630 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  24.96 
 
 
658 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.86 
 
 
624 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.89 
 
 
632 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.18 
 
 
600 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0503971  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.36 
 
 
600 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 
695 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  26.4 
 
 
650 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.07 
 
 
677 aa  144  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  26.4 
 
 
650 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  24.48 
 
 
626 aa  143  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>