More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1547 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  64.7 
 
 
659 aa  847    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  64.55 
 
 
659 aa  847    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  54.49 
 
 
651 aa  664    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  72.63 
 
 
656 aa  954    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 
657 aa  1327    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  58.77 
 
 
658 aa  689    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  58.58 
 
 
660 aa  669    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  64.33 
 
 
678 aa  776    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  60.63 
 
 
540 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  57.57 
 
 
653 aa  560  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  46.94 
 
 
664 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  46.21 
 
 
665 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  47.17 
 
 
662 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  49.71 
 
 
731 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  51.97 
 
 
700 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  51.77 
 
 
700 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  50.99 
 
 
700 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  45.57 
 
 
653 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  43.57 
 
 
652 aa  420  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  42.93 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  40.25 
 
 
657 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  40.15 
 
 
663 aa  375  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  37.1 
 
 
655 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  37.1 
 
 
655 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  42.94 
 
 
694 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  54.34 
 
 
545 aa  353  7e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  55.2 
 
 
544 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  75.42 
 
 
236 aa  350  4e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
649 aa  345  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  35.21 
 
 
654 aa  337  5.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  50.58 
 
 
651 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  47.31 
 
 
654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  46.36 
 
 
656 aa  299  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  37.48 
 
 
604 aa  295  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 
663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  43.27 
 
 
553 aa  234  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  29.19 
 
 
633 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1548  methyl-accepting chemotaxis protein  32.78 
 
 
293 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00384981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  27.35 
 
 
626 aa  154  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  25.77 
 
 
625 aa  143  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 
627 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.75 
 
 
609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0855945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  29.01 
 
 
740 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 
621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  23.58 
 
 
658 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  26.59 
 
 
713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.76 
 
 
666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  25.31 
 
 
627 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 
372 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.86 
 
 
660 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  27.6 
 
 
671 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 
622 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
708 aa  127  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  25.71 
 
 
658 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.06 
 
 
659 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  25.71 
 
 
658 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  45.51 
 
 
661 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 
669 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4046  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.2 
 
 
560 aa  126  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  25.89 
 
 
658 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  25.89 
 
 
658 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3105  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.86 
 
 
767 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.04 
 
 
665 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  25.23 
 
 
658 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 
599 aa  123  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
548 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  49.07 
 
 
431 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  25.38 
 
 
626 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.76 
 
 
658 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 
631 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.65 
 
 
621 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.650368  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.32 
 
 
782 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
832 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  26.11 
 
 
658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.79 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  63.74 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 
680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.81 
 
 
630 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.45 
 
 
682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  26.33 
 
 
626 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  27.03 
 
 
660 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.32 
 
 
650 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  44.58 
 
 
563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 
520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  31.63 
 
 
669 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
548 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 
609 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
609 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.81 
 
 
630 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.97 
 
 
630 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
675 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
555 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>