22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1513 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  663    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000253198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  27.13 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1297  hypothetical protein  30.4 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000358412  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.09 
 
 		 994 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  29.1 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1535  hypothetical protein  31.91 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.771018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  24.56 
 
 		 531 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  26.47 
 
 		 531 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  29.91 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  26.15 
 
 		 259 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 603 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  31.03 
 
 		 682 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 		 648 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  31.03 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  31.58 
 
 		 259 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.04 
 
 		 722 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.22 
 
 		 663 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  28 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  28.71 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 		 492 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  28.97 
 
 		 686 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>